대사체 신호 기반의 세포외 기질(ECM) 리모델링 관련 전사체 조절 네트워크 모델링

본 주제는 세포 외부 환경, 특히 세포외 기질(ECM)의 변화를 감지하는 대사체 신호가 어떻게 세포 내부의 전사체 수준에서 유전자 발현 네트워크를 재구성하여 세포 행동을 조절하는지를 시스템적으로 모델링하는 분야이다.

시스템적 통합

• ECM 구성 성분의 변화(예: 콜라겐 변형)는 세포 표면의 수용체 활성화를 통해 특정 대사 중간체의 농도를 변화시킨다.
• 이러한 대사체 변화는 핵 내 신호 전달 캐스케이드에 영향을 미쳐, 특정 전사 인자의 활성화를 유도한다.
• 최종적으로, 이들 전사 인자는 ECM 리모델링에 관여하는 유전자들의 발현 패턴을 체계적으로 조절하며, 이는 시스템 생물학적 관점에서 해석된다.

이는 단순한 신호 전달을 넘어, 환경 변화에 대한 세포의 적응 전략을 거시적인 네트워크 수준에서 이해하는 데 중요하다.