단일세포 공간 전사체학 데이터에서 세포 간 통신 네트워크 추론을 위한 그래프 이론적 접근법

단일세포 공간 전사체학 데이터는 세포의 공간적 위치 정보를 포함하여 유전자 발현 패턴을 제공하며, 이를 통해 세포 간의 상호작용 네트워크를 구축할 수 있습니다.

네트워크 추론의 기본 원리

• 세포 유형 분류 및 클러스터링을 통해 잠재적 상호작용 파트너를 식별합니다.
• 특정 유전자 발현 패턴(예: 리간드/수용체 쌍)을 기반으로 세포 간 통신 가능성을 확률적으로 계산합니다.
• 이를 위해 그래프 이론을 적용하여 세포들을 노드(Node)로, 통신 가능성을 엣지(Edge)로 표현하는 네트워크를 구성합니다.

이러한 접근법은 시스템 생물학적 관점에서 세포 집단의 기능적 조직화를 이해하는 데 필수적이며, 특히 공간 전사체학 데이터의 고유한 공간적 맥락을 반영합니다. 주요 분석에는 커뮤니티 탐지 알고리즘 등이 활용됩니다.